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Questo studio rivela che la vitrificazione dei tessuti neurali induce una vulnerabilità trascrittomica selettiva, caratterizzata da una sottorappresentazione specifica di trascritti codificanti proteine con architetture integrate nelle membrane e percorsi secretori, con un impatto maggiore nell'ippocampo rispetto alla corteccia cerebrale.
Lo studio dimostra che l'amplificazione pre-genomica mediante DLMDA permette di recuperare DNA da campioni FFPE mantenendo i profili di alterazione del numero di copie, sebbene con una ridotta sensibilità nel rilevare specifiche delezioni e amplificazione.
Questo studio valuta la stabilità a lungo termine di 44 nucleosidi ribosidici in soluzione acquosa, identificando composti degradabili e proponendo linee guida pratiche per la preparazione, lo stoccaggio e il controllo di qualità al fine di migliorare l'affidabilità dell'analisi LC-MS delle modificazioni dell'RNA.
Questo studio dimostra che le transizioni fenotipiche delle cellule muscolari lisce vascolari nell'aterosclerosi sono regolate da un paesaggio epitranscrittomico distinto, caratterizzato da specifiche modifiche dell'uridina che influenzano la regolazione post-trascrizionale nello stato pro-infiammatorio.
Lo studio dimostra che i ribosomi citosolici e quelli associati al reticolo endoplasmatico condividono paesaggi di metilazione 2'-O dell'rRNA quasi identici tra diversi tipi cellulari umani, indicando che tale modificazione non costituisce un segnale specifico per il reclutamento dei ribosomi all'ER né un determinante principale della loro funzione in quel compartimento.
Lo studio dimostra che KDM2B regola l'espressione e l'attività del fattore HIF-1, essenziale per l'adattamento cellulare all'ipossia, attraverso i suoi domini JmjC e CxxC che facilitano il reclutamento della RNA Pol II sul promotore di HIF-1.
Questo studio rivela che le proteine "bicycle" degli afidi, pur non avendo omologia di sequenza, condividono un ripiegamento saposinico-like che si è evoluto rapidamente in strutture diverse per manipolare le piante ospiti ed eludere le loro difese immunitarie.
Lo studio rivela che l'infezione da virus Zika riprogramma l'epitranscrittoma ospite generando nuovi isoformi tramite poliadenilazione alternativa, i quali vengono preferenzialmente metilati da METTL3, portando a un rimodellamento specifico dell'm6A che influenza le vie di segnalazione immunitaria.
Lo studio quantifica il crosstalk dei codici a barre nel sequenziamento ONT, dimostrando che i protocolli standard più vecchi causano un significativo errore di assegnazione, specialmente a basse concentrazioni di DNA, mentre l'aggiornamento del protocollo ONT riduce drasticamente il fenomeno e una procedura interna che prevede il pooling dopo la ligazione degli adattatori lo elimina virtualmente.
Questo studio dimostra che il complesso di rimodellamento della cromatina NuRD è essenziale per il "reset" degli enhancer nelle cellule staminali embrionali di topo in risposta alla segnalazione ERK, un processo che permette un rapido e preciso cambio del programma trascrizionale necessario per il destino cellulare.
Gli autori hanno ottimizzato e ampliato il sistema AID2 per la deplezione rapida delle proteine in *Candida albicans* e *Candida auris*, sviluppando nuovi vettori versatili per ceppi prototrofici, strategie di tagging CRISPR/Cas9 simultaneo e cassette "all-in-one" che ne facilitano l'uso nella comunità di ricerca.
Questo studio presenta un dispositivo ibrido carta-polimero stampato in 3D che utilizza una logica a cascata del DNA mediata dallo spostamento di filamento per rilevare in modo sensibile e specifico il fattore di crescita derivato dalle piastrine BB (PDGF-BB) tramite fluorescenza, offrendo un potenziale strumento diagnostico per la preeclampsia precoce.
Lo studio analizza le interazioni conformazionali e molecolari tra il riboswitch SAM-I e i ligandi SAM, SAH e JS4 per fornire approfondimenti cruciali sulla progettazione di nuovi farmaci antibiotici mirati all'RNA.
La vitamina D3 attenua la tossicità dermica indotta dallo zolfo mustardico rimodellando il microbiota intestinale per arricchire *Akkermansia muciniphila* e aumentare la produzione di butirrato, un effetto mediato dalla via di segnalazione VDR-α-defensina nell'intestino.
Questo studio identifica una mutazione nella struttura ad ansa del microRNA miR-3260 nel baco da seta, che altera la sua sequenza nucleotidica senza influenzare l'attività di taglio da parte di Dicer, suggerendo che tale mutazione non sia responsabile del fenotipo di pelle larvale traslucida osservato.
Questo studio esegue un'analisi genomica completa della famiglia di geni VrHMA nel fagiolo mung, caratterizzandone la struttura e l'espressione sotto stress da metalli pesanti (Zn, Cd e Cu) per delineare il loro ruolo nell'omeostasi dei metalli e fornire basi per il miglioramento genetico della tolleranza agli stress.
Lo studio rivela che lo stallo dei ribosomi, che si verifica preferenzialmente quando i peptidi di transito emergono dal tunnel di uscita, funge da meccanismo regolatorio essenziale per garantire un efficiente targeting delle proteine nucleari verso i cloroplasti in *Arabidopsis thaliana*.
Lo studio dimostra che la riprogrammazione della cellula ospite da parte delle chinasi ciclina-dipendenti, in particolare CDK2, è essenziale per la replicazione e la trascrizione del virus Ebola, suggerendo che l'inibizione di queste chinasi rappresenta una potenziale strategia antivirale.
Questo studio integra dati genomici e funzionali in neuroni dopaminergici umani per identificare varianti regolatorie causali del Parkinson, dimostrando che gli alleli associati alla malattia riducono l'espressione dei geni SCARB2 e BAG3 alterando l'accessibilità della cromatina e il legame dei fattori di trascrizione.
Attraverso il sequenziamento diretto dell'RNA a lettura lunga, gli autori hanno caratterizzato il trascrittoma mitocondriale dello zebrafish, identificando un nuovo lncRNA poliadenilato chiamato lncOriL e confermando la sua ubiquità e regolazione in tutti i vertebrati, inclusi umani e maiali.